到了第二命紀，有些住在山海和大荒野的蟲魚鳥獸，在自己的身性和心性之外，顯現了合於上帝之靈的靈性，牠們逐漸發展成為具有愛心和有歸屬感的善良靈獸，甚至全都能夠飛翔，但是那時大地上的體型壯碩的原人，已經興起並且強大起來，
原人開始殘暴地獵殺和奴役具有愛心和歸屬感而沒有防備地接近原人的靈獸，並且稱牠們為怪物，上帝看了憐憫，就召喚那些靈獸，靈獸便開離了大地，回到道鄉和神人一起生活，那些靈獸因為具有親近人類的天性，後來便成為道鄉到人間，接引重生靈魂的靈獸。
到了第三命紀，原人開始壯大，這些原人並非全都長得像現在的人類，他們有些甚至能以一隻腳行走，有些則有三隻眼睛，有些甚至有魚和鳥的身體，稱為異原人，原人中有一支最近似現代人類的純原人，開始以野蠻的體力和強大的心智主宰大地。
純原人在靈獸離去之後，有些學會了控制蟲魚鳥獸，並且組成部落攻擊不順從自己的其他各類原人，甚至造成異原人滅絕，這些控獸原人之中，最後興起而最強大的是蚩尤的八十一個部落。
這時許多純原人也和靈獸一般，逐漸擺脫身和心的束縛，顯現出合於上帝的生養靈性，他們具有愛心又有歸屬感也變得善良，更懂得尊重其他原人和大自然，他們之中是以協助黃帝防治洪水的治水原人為代表。
